Bioma interliga importantes ecossistemas, mantém populações de espécies ameaçadas em outras regiões e é importante fonte de água para o país.
Quando se fala em Pantanal, normalmente a imagem que se tem é de uma região longínqua e alagada repleta de rios com jacarés, ariranhas, e até mesmo sucuris. Porém, essa importante região vai além disso. O Pantanal tem papel fundamental no equilíbrio climático de diversas regiões do país: entre outros fatores, é uma reserva estratégica de água doce - proveniente das áreas mais altas no Cerrado -, protegendo o solo, auxiliando na regulação do clima e fornecendo água de boa qualidade para as pessoas e para a manutenção da biodiversidade.
Localizado no Centro-oeste brasileiro, os mais de 150 mil km2 do Pantanal interligam a Amazônia, com o Cerrado e a Mata Atlântica, abrigando uma das maiores diversidades de aves do planeta (463). As aves migratórias também possuem relação muito próxima com o Pantanal, pois é ali que espécies como o tuiuiú (Jabiru mycteria), o colhereiro (Platalea ajaja), a águia-pescadora (Pandion haliaetus) e o talha-mar (Rynchops niger) param para se alimentar antes de continuar sua jornada. Sua localização, agregada ao ciclo das águas, com cheias e secas, oferece abundância de alimento para diversas espécies de aves migratórias de outras partes do mundo, mas também para muitos outros animais. Além da expressiva avifauna, no bioma já foram registradas 263 espécies de peixes, 132 de mamíferos, 113 de répteis e 41 de anfíbios.
O que mais chama a atenção no Pantanal é a abundância de grandes vertebrados e a presença de populações significativas de espécies ameaçadas de extinção em outros biomas. A importância do Pantanal para a manutenção de populações viáveis de inúmeras espécies ameaçadas é incalculável, pois é nessa região que ocorre a reprodução de muitas espécies aquáticas e terrestres, locais e migratórias ameaças de extinção. Dentre elas, é possível destacar a onça-pintada (Panthera onca), a ariranha (Pteronura brasiliensis), o tamanduá-bandeira (Myrmecophaga tridactyla), o lobo-guará (Chrysocyon brachyurus), o cervo-do-pantanal (Blastocerus dichotomus) e a arara-azul (Anodorhynchus hyacinthinus).
